Além deles, outros 12 clubes entram diretamente na 3ª fase: Athletico-PR , Atlético-MG , Botafogo , Flamengo , Fluminense , Grêmio , Palmeiras , Red Bull Bragantino e São Paulo pela CONMEBOL Libertadores , Vitória por ter sido campeão da Série B do Brasileiro, Ceará pelo título da Copa do Nordeste e Goiás por ter conquistado a Copa Verde.

Os 32 classificados serão divididos em dois grupos levando em consideração a classificação no ranking nacional de clubes da CBF. Os times do pote A enfrentam os times do pote B. A novidade é que na 3ª fase o classificado é definido em jogos de ida e volta. Em caso de igualdade na soma dos resultados, a disputa vai para os pênaltis. Quem passar embolsa mais R$ 3,4 milhões. Confira como será a divisão dos potes na Copa do Brasil: