Nessa mesma época, na campanha histórica do Paulista de 1996, o Verdão marcou mais de 100 gols, em uma dura batalha contra a Portuguesa. A partida estava empatada em 1 a 1 quando Djalminha acabou sendo expulso. Diante do cenário, Cafu e companhia tiveram de superar a desvantagem numérica para marcar o segundo e sair de campo com a vitória.

A grande campanha resultou na conquista do Campeonato Paulista de 1996, após vencer o Santos na final por 2 a 0, o que representou o primeiro e único título de Cafu pelo Verdão.

Em 1997, Cafu fez o último de seus 16 gols pelo Palmeiras na partida contra o Mogi Mirim, pelo Campeonato Paulista daquele ano. Além disso, o confronto foi o penúltimo de sua trajetória pelo clube. Depois da goleada sobre o Mogi Mirim, o Palmeiras enfrentou o São Paulo e foi derrotado por 4 a 1. Apesar do resultado negativo, o jogo foi o último de Cafu pelo Palestra. O lateral havia sido negociado com a Roma, da Itália, encerrando sua passagem pelo Verdão.