Em 1999, foi emprestado à Matonense e ao Vitória, onde brilhou no Campeonato Brasileiro, ajudando a equipe baiana a chegar às semifinais. Em 2000, foi negociado com o Las Palmas, da Espanha, mas não se adaptou e voltou ao Brasil para jogar no Atlético Mineiro. Em 2003, Baiano foi contratado pelo Palmeiras para a disputa da Série B. Herdou a camisa 2 e foi peça fundamental na campanha do título e retorno à elite. As boas atuações o levaram ao Boca Juniors em 2005, onde conquistou a Copa Sul-Americana, a Recopa e o Apertura.

Apesar de ter se tornado titular rapidamente, Baiano enfrentou preconceito racial e xenofobia na Argentina, o que pesou para seu retorno ao Brasil. Depois disso, jogou no Rubin Kazan (Rússia), Náutico, Fortaleza, Vasco, Atlético Nacional (Colômbia), Guarani e Paulista, além de outros clubes brasileiros de menor expressão. Baiano teve uma carreira extensa, atuando por mais de 20 clubes.

Entre suas conquistas, estão títulos relevantes como: Torneio Rio-São Paulo (1997 – Santos) Copa Conmebol (1998 – Santos) Série B (2003 – Palmeiras) Copa Sul-Americana, Recopa e Apertura (2005 – Boca Juniors) Campeonato Brasiliense (2013 – Brasiliense) Série C (2015 – Vila Nova) Campeonato Brasiliense (2015 – Gama)