Um dos pontos mais debatidos foi o pênalti não marcado em Gonzalo Tapia, que foi derrubado na área por Allan. O árbitro Ramon Abatti Abel não recorreu ao monitor do VAR, o que inicialmente impediu a divulgação imediata das informações. Após a revisão, a equipe de arbitragem de vídeo defendeu que o contato foi um "escorregão acidental". “A bola está passando. Pode seguir”, foi o que declarou Abatti Abel, enquanto o VAR afirmou que o contato era acidental e que a bola estava saindo da área.

O São Paulo insiste que a não marcação do pênalti poderia ter impactado o resultado do jogo. Além do lance que gerou polêmica, o Tricolor questionou outros quatro: dois pênaltis não assinalados em Tapia, a não expulsão de Andreas Pereira, uma falta não marcada após uma cotovelada de Gustavo Gómez e uma falta que ocorreu na origem do primeiro gol do Palmeiras.

Referente ao lance de Andreas Pereira, os dirigentes do São Paulo criticaram a decisão, pois o meio-campista recebeu apenas um cartão amarelo após uma entrada em Marcos Antônio. O VAR solicitado para revisar o lance concluiu que o contato não era pleno na canela e envolvia apenas uma intensidade média de disputa.

Em relação ao pisão de Gustavo Gómez, a arbitragem decidiu que não houve intenção, o que foi corroborado pelo VAR. “Pra mim tem o pisão, mas sem intenção. Tem um pisão de disputa”, afirmou o árbitro. Outro lance envolvendo Gómez foi o toque de seu cotovelo no rosto de Tapia, que também foi objeto de revisão. O VAR observou que não houve ação deliberada de cotovelada durante o lance.