O uruguaio, que frequentemente era convocado por Marcelo Bielsa para a seleção do Uruguai, deve aproveitar a oportunidade e conquistar um papel de destaque no Palmeiras. Apesar de ter terminado o ano tratando de um problema no pé esquerdo, ele deve estar disponível na reapresentação do time, marcada para o dia 4 de janeiro. Emiliano já tinha uma breve experiência no Brasil, quando passou pelo Red Bull Bragantino, e demonstrou boa adaptação logo que chegou ao Palmeiras, onde assinou até dezembro de 2029.

Na sua estreia oficial, durante um empate em 1 a 1 contra o Corinthians na primeira fase do Paulista, Martínez permaneceu no banco. No entanto, em sua partida como titular contra a Inter de Limeira, no dia 13 de fevereiro, ele começou a se destacar. Ao longo do tempo, ele disputou 20 jogos, sendo 17 como titular, e marcou seu único gol no clube em uma vitória sobre o Corinthians pelo Brasileirão. Sua jornada teve altos e baixos, e ele chegou à Copa do Mundo de Clubes como reserva, até que a lesão de Aníbal Moreno lhe proporcionou novas chances de jogar.

No segundo semestre, Emiliano atuou em 20 partidas, 12 delas como titular. Em um jogo da Copa do Brasil contra o Corinthians, ele entrou durante o intervalo, quando a equipe já contava com um jogador a menos. No final do ano, diante do desempenho insatisfatório tanto dele quanto de Aníbal, o técnico Abel Ferreira decidiu improvisar Bruno Fuchs na posição. No total, Martínez participou de 48 jogos nesta temporada e anotou um gol, com números expressivos em sua performance: 25 finalizações, sendo 12 no alvo, 87,8% de aproveitamento nos passes e 76 desarmes.