A competição é composta por quatro fases, sendo duas de grupos e duas de mata-matas (semi e final). Durante a primeira, os clubes estão divididos em quatro grupos com cinco equipes cada, que se enfrentam somente em jogos de ida, classificando-se os dois primeiros. O Palmeiras está no Grupo B junto a Grêmio, Chapecoense, Fluminense e Ponte Preta.
Os oito clubes remanescentes serão sorteados em dois novos grupos na segunda fase, com quatro times cada, que se enfrentarão em turno e returno – novamente, os dois melhores de cada seguem para a semifinal. O campeão do Brasileiro Sub-20 enfrenta o campeão da Copa do Brasil Sub-20 na Supercopa do Brasil Sub-20, que vale vaga na Libertadores Sub-20 2019.
O Grêmio é conhecido do Sub-20 do Palmeiras. As duas equipes se encontraram nas quartas de final da Copa do Brasil da categoria, em abril, e o Verdão teve grande desempenho: venceu por 4 a 0 em Eldorado do Sul e por 4 a 1 na partida de volta, em Itu-SP. A Ponte Preta também foi adversário na final do Paulista Sub-20 do ano passado, vencido pelo Verdão no Pacaembu.